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課程簡介
Fiji和ImageJ的介紹
- Fiji及其在科學研究中的應用概述
- 了解ImageJ的架構和插件
- 安裝和設置Fiji以獲得最佳性能
基本圖像處理技術
- 圖像獲取和導入格式
- 調整對比度、亮度和應用過濾器
- 圖像堆疊和投影方法
進階Image Analysis
- 分段技術:閾值化和邊緣檢測
- 組織學樣本中物體計數和粒子分析
- 測量區域、周長和其他形態特徵
處理Biological樣本
- 處理組織學組織、血細胞和藻類的圖像
- 染色組織的顏色解卷和分析
- 時隙分析和跟踪細胞運動
自動化和定制
- 為重複性任務創建和運行宏
- 使用Fiji插件進行專門分析
- 使用ImageJ宏語言(IJM)進行基本腳本編寫
Data Management和報告
- 導出結果和生成報告
- 對圖像進行標註並準備數據以供發布
- 可重複圖像分析的最佳實踐
總結和結論
最低要求
- 生物成像概念的基本了解
- 熟悉顯微鏡和組織學技術
- 基本的計算機使用能力
受眾
- 生物技術和環境毒理學的研究人員
- 從事組織學和細胞成像的實驗室技術人員
- 對定量圖像分析感興趣的科學家
14 時間: